Perguntas com a marcação «mixed-model»

Eu tenho usado o MCMCglmmpacote recentemente. Estou confuso com o que é referido na documentação como estrutura R e estrutura G. Eles parecem estar relacionados aos efeitos aleatórios - em particular especificando os parâmetros para a distribuição anterior sobre eles, mas a discussão na documentação parece assumir que o leitor …

16 r  bayesian  mixed-model  lme4-nlme 

Olá gurus estatísticos e assistentes de programação R, Estou interessado em modelar capturas de animais em função das condições ambientais e do dia do ano. Como parte de outro estudo, tenho contagens de capturas em ~ 160 dias em três anos. Em cada um desses dias, tenho temperatura, precipitação, velocidade …

16 r  mixed-model  autocorrelation  bugs  panel-data 

Várias descrições na seleção de modelos sobre efeitos aleatórios de Modelos Mistos Lineares instruem a usar REML. Conheço a diferença entre REML e ML em algum nível, mas não entendo por que REML deve ser usado porque ML é tendencioso. Por exemplo, é errado realizar um LRT em um parâmetro …

16 mixed-model  maximum-likelihood  unbiased-estimator  likelihood-ratio  reml 

Dada uma variável prevista (P), um efeito aleatório (R) e um efeito fixo (F), pode-se ajustar dois * modelos de efeitos mistos ( sintaxe lme4 ): m1 = lmer( P ~ (1|R) + F ) m2 = lmer( P ~ (1+F|R) + F) Pelo que entendi, o segundo modelo é …

16 mixed-model 

Digamos que temos um modelo mod <- Y ~ X*Condition + (X*Condition|subject) # Y = logit variable # X = continuous variable # Condition = values A and B, dummy coded; the design is repeated # so all participants go through both Conditions # subject = random effects for different …

16 mixed-model  lme4-nlme  overfitting  singular 

Li várias vezes que efeitos aleatórios (BLUPs / modos condicionais para, digamos, sujeitos) não são parâmetros de um modelo linear de efeitos mistos, mas podem ser derivados dos parâmetros estimados de variância / covariância. Por exemplo, Reinhold Kliegl et al. (2011) afirmam: Efeitos aleatórios são os desvios dos indivíduos em …

15 mixed-model  intuition  blup 

Estou tentando usar lme4::glmer()para ajustar um modelo misto generalizado binomial (GLMM) com variável dependente que não é binária, mas uma variável contínua entre zero e um. Pode-se pensar nessa variável como uma probabilidade; de fato, é a probabilidade relatada por seres humanos (em um experimento que ajudo a analisar). Ou …

15 r  logistic  mixed-model  glmm  lme4-nlme 

A questão CV Estou tentando fornecer (a) representações matemáticas detalhadas e concisas de um modelo de efeitos mistos. Estou usando o lme4pacote em R. Qual é a representação matemática correta para o meu modelo? Dados, Questão Científica e Código R Meu conjunto de dados consiste em espécies em diferentes regiões. …

15 r  mixed-model  multilevel-analysis  lme4-nlme 

Em um modelo de efeitos mistos, a recomendação é usar um efeito fixo para estimar um parâmetro se todos os níveis possíveis forem incluídos (por exemplo, homens e mulheres). Recomenda-se ainda o uso de um efeito aleatório para contabilizar uma variável se os níveis incluídos forem apenas uma amostra aleatória …

15 mixed-model  random-effects-model  fixed-effects-model  many-categories 

Os testes de permutação (também chamados de teste de randomização, teste de re-randomização ou teste exato) são muito úteis e úteis quando a suposição de distribuição normal exigida por, por exemplo, t-testnão é atendida e quando a transformação dos valores pela classificação do teste não-paramétrico como Mann-Whitney-U-testlevaria a mais informações …

15 hypothesis-testing  permutation-test  exchangeability  r  statistical-significance  loess  data-visualization  normal-distribution  pdf  ggplot2  kernel-smoothing  probability  self-study  expected-value  normal-distribution  prior  correlation  time-series  regression  heteroscedasticity  estimation  estimators  fisher-information  data-visualization  repeated-measures  binary-data  panel-data  mathematical-statistics  coefficient-of-variation  normal-distribution  order-statistics  regression  machine-learning  one-class  probability  estimators  forecasting  prediction  validation  finance  measurement-error  variance  mean  spatial  monte-carlo  data-visualization  boxplot  sampling  uniform  chi-squared  goodness-of-fit  probability  mixture  theory  gaussian-mixture  regression  statistical-significance  p-value  bootstrap  regression  multicollinearity  correlation  r  poisson-distribution  survival  regression  categorical-data  ordinal-data  ordered-logit  regression  interaction  time-series  machine-learning  forecasting  cross-validation  binomial  multiple-comparisons  simulation  false-discovery-rate  r  clustering  frequency  wilcoxon-mann-whitney  wilcoxon-signed-rank  r  svm  t-test  missing-data  excel  r  numerical-integration  r  random-variable  lme4-nlme  mixed-model  weighted-regression  power-law  errors-in-variables  machine-learning  classification  entropy  information-theory  mutual-information 

Um dos problemas que sempre tive com modelos mistos é descobrir visualizações de dados - do tipo que pode acabar em um papel ou pôster - depois de obter os resultados. No momento, estou trabalhando em um modelo de efeitos mistos de Poisson com uma fórmula semelhante à seguinte: a …

15 r  data-visualization  mixed-model 

Eu tenho uma pergunta sobre o uso de uma variável de agrupamento em um modelo não linear. Como a função nls () não permite variáveis ​​de fator, tenho me esforçado para descobrir se é possível testar o efeito de um fator no ajuste do modelo. Incluí um exemplo abaixo, no …

15 r  mixed-model  nls 

Estou decentemente familiarizado com os modelos de efeitos mistos (MEM), mas um colega recentemente me perguntou como ele se compara aos modelos de crescimento latente (LGM). Pesquisei um pouco no Google e parece que o LGM é uma variante da modelagem de equações estruturais aplicada a circunstâncias em que medidas …

15 mixed-model  panel-data 

Eu tenho um experimento que tentarei abstrair aqui. Imagine que eu jogo três pedras brancas na sua frente e peço que faça um julgamento sobre a posição delas. Registro uma variedade de propriedades das pedras e sua resposta. Eu faço isso em vários assuntos. Eu gero dois modelos. Uma é …

15 r  mixed-model  model-selection 

Gostaria de combinar as saídas do lmer (realmente glmer) com um exemplo binomial de brinquedo. Eu li as vinhetas e acredito que entendo o que está acontecendo. Mas aparentemente eu não. Depois de ficar preso, consertei a "verdade" em termos dos efeitos aleatórios e fui atrás da estimativa dos efeitos …

15 r  mixed-model  optimization  lme4-nlme